2008年6月，南京航空航天大學從直屬于國防科工委調(diào)整為直屬于工業(yè)和信息化部。工業(yè)和信息化部主管全國70%的工業(yè)行業(yè)，因此，南京航空航天大學的就業(yè)領(lǐng)域除傳統(tǒng)的航空航天民航外，也廣泛涉及電子、通信、煙草、汽車等行業(yè)。

近年畢業(yè)生主要就業(yè)單位有：
國防單位及國有大型企業(yè)：中國航空工業(yè)集團公司及其下屬單位、中國商用飛機有限責任公司、中國航天科技集團公司及其下屬單位、中國航天科工集團公司及其下屬單位、中國電子科技集團公司及其下屬單位、中國核工業(yè)集團公司及其下屬單位、中國船舶重工集團公司及其下屬單位、中國船舶工業(yè)集團公司及其下屬單位等
國內(nèi)航空公司：中國南方航空股份有限公司、中國東方航空股份有限公司、中國國際航空股份有限公司、中國海南航空股份有限公司、深圳航空有限責任公司、廈門航空有限責任公司、上海航空股份有限公司、北京首都航空有限公司等
國外航空公司：美國西北航空公司、德國漢莎航空公司、荷蘭皇家航空公司等
機場集團：上海機場、首都機場、西部機場、白云機場、浦東機場、祿口機場等
中央部委局：中國民用航空局、國家安全部、國家知識產(chǎn)權(quán)局、國家外交部等
信息產(chǎn)業(yè)類企業(yè)：中興通訊股份有限公司、華為技術(shù)有限公司、中國移動通信集團、中國聯(lián)合通訊有限公司、中國電信集團公司等
世界五百強企業(yè)：微軟（中國）有限公司、空中客車公司、摩托羅拉（中國）電子有限公司、IBM（中國）有限公司、雅虎（中國）有限公司、寶潔公司、福特汽車（中國）有限公司等。